Тематическая структура гимназических проектов соответствует направлениям, реализуемым Научно-образовательными школами МГУ имени М.В. Ломоносова (НОШ МГУ). Межфакультетские Научно-образовательные школы обеспечивают развитие перспективных междисциплинарных научно-образовательных направлений.